Amino bilgisi

Kimya size bir amino asidin hem karboksilik asit hem de amino fonksiyonel gruplara sahip herhangi bir molekül olduğunu söyleyecektir. Bir proteinin temel yapı birimleridir. Biyokimyada, alfa amino asitleri ifade etmek için daha kısa ve daha genel bir terim kullanılır. Bunlar, amino ve karboksilat işlevselliklerinin ortak bir karbona eklendiği amino asitlerdir. Amino asitlerin kalıntısı, bir peptit bağı oluşumunda bir su molekülü kaybolduğunda bir amino asitten geriye kalan kısımdır. Peptitler, vücudumuzdaki protieni oluşturan polimer zincirlerdir.

Standart genetik kod ile yirmi amino asit kodlanacaktır. Bunlara proteinojenik veya standart Amino asitler denir. Daha karmaşık olanlar vücudumuz tarafından üretilir ve standart dışı olarak adlandırılır (bunlar o kadar yaygın değildir). Prolin, yan grubu a-amino grubuna bağlanan ve siklik olan tek proteinojenik amino asittir. Bu ikincil bir amino grubu oluşturur. Önceleri, proline yanıltıcı olan ve değiştirilen “imino” olarak adlandırılıyordu. Protiens, genellikle translasyon sonrası modifikasyonla (tercüme SONRASI modifikasyonlar) oluşan diğer amino asitleri içerir. Bu modifikasyonlar, proteinin işlevi için gereklidir. Standart 20’den başka en az iki amino asit bazen translasyon işlemi sırasında proteinlere dahil edilir.

Sadece 20 amino asit genetik olarak kodlanmış olsa da, doğada yüzden fazla amino asit bulunmuştur. Bunlardan bazıları meteorlarda, özellikle karbonlu kondrit adı verilen bir türde görülmüştür. Mikroorganizmalar ve bitkiler genellikle, peptidik antibiyotiklerde bulunan, biraz nadir amino asitler üretebilirler. Lantiyonin, mikrobiyal kökenli antibiyotik peptitler olan “lantibiyotiklerde” doymamış amino asitlerle birlikte bulunan sülfit köprülü bir alanin dimeridir.

Protein sentezinin yanı sıra, amino asitlerin biyolojik olarak önemli başka görevleri de vardır. Glisin ve glutamat, nörotransmiterler olarak ve proteinlerde standart amino asitler olarak kullanılır. Pek çok amino asit, nörotransmiter serotoninin öncüsü olan triptofan ve heme gibi porfirin sentezindeki birkaç reaktandan biri olan glisin gibi diğer molekülleri sentezleme rolünü üstlenir. Heme, proteinin oluşumunda da önemli olan “hemoglobin” içindedir. Sayısız, standart olmayan amino asit biyolojik olarak önemlidir: “GABA”, hücre içinde lipit taşınmasında kullanılan başka bir nörotransmiter, karnitin, sitrülin, ornitin, hidroksiprolin, hidroksilisin, homosistein ve sarkosin.